More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0506 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1275  16S ribosomal RNA  93.99 
 
 		 1513 bp  2190    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0517  16S ribosomal RNA  93.92 
 
 		 1513 bp  2183    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.635993  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r04  16S ribosomal RNA  95.32 
 
 		 1723 bp  1978    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1800  16S ribosomal RNA  91.79 
 
 		 1511 bp  1917    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj16SA  16S ribosomal RNA  94.19 
 
 		 1513 bp  2214    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj16SB  16S ribosomal RNA  94.19 
 
 		 1513 bp  2214    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj16SC  16S ribosomal RNA  94.19 
 
 		 1513 bp  2214    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0460  16S ribosomal RNA  93.92 
 
 		 1513 bp  2183    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2336  16S ribosomal RNA  95.42 
 
 		 1458 bp  2323    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2339  16S ribosomal RNA  95.42 
 
 		 1458 bp  2323    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.474601  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1465  16S ribosomal RNA  93.92 
 
 		 1513 bp  2183    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2342  16S ribosomal RNA  95.42 
 
 		 1458 bp  2323    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0032  16S ribosomal RNA  93.99 
 
 		 1513 bp  2190    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1524  16S ribosomal RNA  93.99 
 
 		 1513 bp  2190    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0018  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1448 bp  1076    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0022  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1448 bp  1076    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0031  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1448 bp  1076    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0059  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1448 bp  1076    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1806  16S ribosomal RNA  91.79 
 
 		 1511 bp  1917    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r01  16S ribosomal RNA  95.32 
 
 		 1723 bp  1978    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1803  16S ribosomal RNA  91.79 
 
 		 1511 bp  1917    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0148502  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1724  16S ribosomal RNA  93.92 
 
 		 1513 bp  2183    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69789  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0152  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1461 bp  2896    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0506  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1461 bp  2896    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.213034  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0592  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1461 bp  2896    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518963  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r06  16S ribosomal RNA  95.32 
 
 		 1723 bp  1978    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0055  16S ribosomal RNA  89.03 
 
 		 1497 bp  1566    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0037  16S ribosomal RNA  88.96 
 
 		 1497 bp  1558    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0042  16S ribosomal RNA  88.96 
 
 		 1497 bp  1558    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1704  16S ribosomal RNA  93.92 
 
 		 1513 bp  2183    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1711  16S ribosomal RNA  93.78 
 
 		 1511 bp  2151    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0005  16S ribosomal RNA  83.53 
 
 		 1551 bp  400  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.872751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0021  16S ribosomal RNA  83.53 
 
 		 1551 bp  400  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.184479  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0016  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1525 bp  392  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0052  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1525 bp  392  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00180214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0039  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1545 bp  379  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0012  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1545 bp  379  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0011  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1556 bp  379  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0012  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1550 bp  379  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0039  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1550 bp  379  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0011  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1542 bp  379  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0038  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1542 bp  379  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106997  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3700  16S ribosomal RNA  82.75 
 
 		 1534 bp  371  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000788136  normal  0.0665123 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4101  16S ribosomal RNA  82.75 
 
 		 1534 bp  371  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000255406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4388  16S ribosomal RNA  82.75 
 
 		 1534 bp  371  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00500579  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0288  16S ribosomal RNA  82.75 
 
 		 1534 bp  371  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00456088  normal  0.440004 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4195  16S ribosomal RNA  82.75 
 
 		 1534 bp  371  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000110029  normal  0.531054 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0011  16S ribosomal RNA  82.88 
 
 		 1532 bp  365  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000927448  normal  0.022116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0110  16S ribosomal RNA  82.88 
 
 		 1532 bp  365  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.322172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0006  16S ribosomal RNA  82.88 
 
 		 1532 bp  365  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00024387  hitchhiker  0.000899429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0042  16S ribosomal RNA  82.88 
 
 		 1532 bp  365  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00864789  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0077  16S ribosomal RNA  82.88 
 
 		 1532 bp  365  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44822  hitchhiker  0.00000268653 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0100  16S ribosomal RNA  82.88 
 
 		 1532 bp  365  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000228355  hitchhiker  0.0000041645 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0097  16S ribosomal RNA  82.88 
 
 		 1532 bp  365  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000952791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0103  16S ribosomal RNA  82.88 
 
 		 1532 bp  365  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0217624  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4455  16S ribosomal RNA  82.81 
 
 		 1542 bp  363  9e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000515772  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3592  16S ribosomal RNA  82.6 
 
 		 1533 bp  363  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000422776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4124  16S ribosomal RNA  82.81 
 
 		 1542 bp  363  9e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000130158  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4218  16S ribosomal RNA  82.6 
 
 		 1534 bp  363  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000122042  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4509  16S ribosomal RNA  82.45 
 
 		 1534 bp  355  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00650936  normal  0.0273427 
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00001  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1542 bp  353  9e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.01898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00006  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1542 bp  353  9e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0446208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00011  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1542 bp  353  9e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0360816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00020  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1542 bp  353  9e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0003  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1530 bp  353  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000874227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0027  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1530 bp  353  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0090  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1530 bp  353  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000103004  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0098  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1530 bp  353  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000143523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0103  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1530 bp  353  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00308735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0113  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1530 bp  353  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000562425  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3831  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1542 bp  353  9e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000202971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4422  16S ribosomal RNA  83.81 
 
 		 1534 bp  353  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000298898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4457  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1541 bp  353  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4785  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1542 bp  353  9e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000049499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0091  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1534 bp  353  9e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000696463  normal  0.921174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0213  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1542 bp  353  9e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000189444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0120  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1534 bp  353  9e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000197743  hitchhiker  0.0000221827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0005  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1534 bp  353  9e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000862102  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3067  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1542 bp  353  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0166261  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4501  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1542 bp  353  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000270419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0195  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1542 bp  353  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000218892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5104  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1542 bp  353  9e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000547269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5091  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1541 bp  353  9e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000318785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4815  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1542 bp  353  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4374  16S ribosomal RNA  83.81 
 
 		 1534 bp  353  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610581  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0001  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1530 bp  353  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0399609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4800  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1543 bp  353  9e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000095563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5003  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1542 bp  353  9e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4805  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1542 bp  353  9e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000322595  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0130  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1534 bp  353  9e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000346154  decreased coverage  0.00328015 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4732  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1542 bp  353  9e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659975  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0009  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1528 bp  353  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00928732  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0080  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1528 bp  353  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0329076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0087  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1530 bp  353  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.038848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0098  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1530 bp  353  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0103  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1530 bp  353  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.460408  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0019  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1549 bp  347  5.999999999999999e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.163804  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0163  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1549 bp  347  5.999999999999999e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0633257  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1708  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1549 bp  347  5.999999999999999e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1835  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1549 bp  347  5.999999999999999e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.364981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>