29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0235 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0235  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 48 aa  99.8  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0988  50S ribosomal protein L32  95.83 
 
 		 48 aa  97.1  7e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0227  ribosomal protein L32  91.67 
 
 		 50 aa  94  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1490  50S ribosomal protein L32  87.5 
 
 		 48 aa  89.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.334451  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1336  50S ribosomal protein L32  85.42 
 
 		 48 aa  87  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0375  50S ribosomal protein L32  85.42 
 
 		 48 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1628  50S ribosomal protein L32  87.5 
 
 		 48 aa  86.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.901218  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0352  50S ribosomal protein L32  85.42 
 
 		 48 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1773  50S ribosomal protein L32  79.17 
 
 		 49 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 57 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 57 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 57 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  48.98 
 
 		 58 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0633  ribosomal protein L32  45.83 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  41.67 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  44.9 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2140  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>