18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02070 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02070  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  388  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273031  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0523  hypothetical protein  67.74 
 
 
189 aa  275  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2172  hypothetical protein  63.68 
 
 
190 aa  263  8.999999999999999e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2899  hypothetical protein  54.55 
 
 
199 aa  228  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4023  hypothetical protein  55.68 
 
 
192 aa  223  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0933  hypothetical protein  54.5 
 
 
191 aa  222  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0475  hypothetical protein  54.3 
 
 
195 aa  221  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.33606  normal  0.699739 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1555  hypothetical protein  54.21 
 
 
190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247042  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0649  hypothetical protein  46.2 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2653  hypothetical protein  33.16 
 
 
197 aa  148  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1548  hypothetical protein  32.97 
 
 
190 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1441  hypothetical protein  35.52 
 
 
183 aa  121  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46496  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0780  hypothetical protein  31.87 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247882  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0928  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1206  hypothetical protein  30.81 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1115  hypothetical protein  29.1 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1177  hypothetical protein  36.26 
 
 
183 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.518058 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0935  hypothetical protein  25.53 
 
 
266 aa  41.6  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0724054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>