16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0032 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0032  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  175  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7049  hypothetical protein  95.29 
 
 
86 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0979561 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4119  hypothetical protein  78.82 
 
 
85 aa  140  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2212  hypothetical protein  49.41 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1936  hypothetical protein  48.24 
 
 
92 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.526539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3462  hypothetical protein  44.05 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.438272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0631  hypothetical protein  42.86 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1827  hypothetical protein  42.35 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6355  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7138  hypothetical protein  40.24 
 
 
88 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2566  hypothetical protein  39.29 
 
 
85 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1870  hypothetical protein  36.47 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000823152  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5414  hypothetical protein  34.52 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4381  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.735891 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4810  hypothetical protein  42.53 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0802082  hitchhiker  0.00240732 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2786  hypothetical protein  36.47 
 
 
91 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.758487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>