17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3515 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3515  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780841  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2764  hypothetical protein  62.5 
 
 		 76 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563488  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4000  hypothetical protein  58.67 
 
 		 76 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0651  hypothetical protein  61.64 
 
 		 74 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3406  hypothetical protein  60.27 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0689  hypothetical protein  60.27 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9093  hypothetical protein  60.27 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.313804  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7046  transposase  60.27 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1790  preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)  55.26 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.896296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4100  hypothetical protein  48.65 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3434  hypothetical protein  52.7 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2155  preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)  55.56 
 
 		 77 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0962171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3115  ISPpu13, transposase Orf3  44.58 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.542239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3984  ISPpu13, transposase Orf3  44.58 
 
 		 86 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4505  ISPpu13, transposase Orf3  35.06 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1013  hypothetical protein  47.62 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000332135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0199  hypothetical protein  61.9 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>