49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0642 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0642  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3317  hypothetical protein  93.85 
 
 
65 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426969  normal  0.539995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0422  hypothetical protein  89.23 
 
 
65 aa  120  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.689334  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0243  hypothetical protein  75.81 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0742  hypothetical protein  75.81 
 
 
65 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0728  hypothetical protein  75.81 
 
 
65 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2374  hypothetical protein  75.81 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2455  hypothetical protein  75.81 
 
 
65 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2703  hypothetical protein  75.81 
 
 
65 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0602  hypothetical protein  75.81 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0909  hypothetical protein  75.81 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2728  hypothetical protein  72.58 
 
 
65 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0564162  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2600  hypothetical protein  72.58 
 
 
65 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187029  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0622  hypothetical protein  74.19 
 
 
65 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2704  hypothetical protein  74.19 
 
 
65 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28168  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6003  hypothetical protein  72.58 
 
 
65 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.339564  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2675  hypothetical protein  74.19 
 
 
65 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358279  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2064  hypothetical protein  74.19 
 
 
65 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635897  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6003  hypothetical protein  61.9 
 
 
65 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46966  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2359  hypothetical protein  57.81 
 
 
65 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6395  hypothetical protein  62.3 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6100  hypothetical protein  60.66 
 
 
78 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3086  hypothetical protein  64.52 
 
 
81 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3421  hypothetical protein  62.3 
 
 
82 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2613  hypothetical protein  62.3 
 
 
82 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28973  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2425  hypothetical protein  62.3 
 
 
82 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1202  hypothetical protein  62.3 
 
 
82 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0341  hypothetical protein  62.3 
 
 
82 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3386  hypothetical protein  62.3 
 
 
82 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6249  hypothetical protein  62.3 
 
 
92 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1582  hypothetical protein  62.3 
 
 
92 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3432  hypothetical protein  62.9 
 
 
81 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701401  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6725  hypothetical protein  62.3 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.968891  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5256  hypothetical protein  60.66 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0576565  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2090  hypothetical protein  53.12 
 
 
68 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.975538 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5483  hypothetical protein  46.15 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.705452  hitchhiker  0.000639682 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7076  hypothetical protein  46.88 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5133  hypothetical protein  47.62 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987085  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3762  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.668308  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4839  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6333  hypothetical protein  42.86 
 
 
69 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5603  hypothetical protein  42.86 
 
 
69 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.887809  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7026  hypothetical protein  46.88 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12669  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1339  hypothetical protein  39.06 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.618355  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6490  hypothetical protein  39.06 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00628682  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3914  hypothetical protein  52.5 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4805  hypothetical protein  40.3 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6080  hypothetical protein  39.06 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0723054 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4807  hypothetical protein  33.77 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>