55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0535 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0535  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3423  hypothetical protein  96.31 
 
 
217 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172088  normal  0.0352219 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2626  hypothetical protein  89.4 
 
 
217 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0510  hypothetical protein  71.16 
 
 
214 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0534  hypothetical protein  71.16 
 
 
214 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3286  hypothetical protein  71.63 
 
 
218 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3500  hypothetical protein  71.63 
 
 
218 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.591854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3462  hypothetical protein  71.63 
 
 
218 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3497  hypothetical protein  71.63 
 
 
218 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1278  hypothetical protein  71.63 
 
 
218 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0419  hypothetical protein  71.63 
 
 
218 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2498  hypothetical protein  71.16 
 
 
218 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168198  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0126  hypothetical protein  72.09 
 
 
214 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0577  hypothetical protein  72.09 
 
 
214 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000406376 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2776  hypothetical protein  72.09 
 
 
214 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.584619  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0609  hypothetical protein  72.09 
 
 
214 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1166  hypothetical protein  73.02 
 
 
218 aa  293  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3691  hypothetical protein  68.84 
 
 
214 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3061  hypothetical protein  60.09 
 
 
227 aa  268  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3027  hypothetical protein  61.54 
 
 
224 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2862  hypothetical protein  60.09 
 
 
229 aa  264  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2617  hypothetical protein  61.09 
 
 
224 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.583779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2783  hypothetical protein  62.9 
 
 
224 aa  251  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3394  hypothetical protein  46.46 
 
 
198 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.843919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0855  hypothetical protein  46.67 
 
 
200 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.942711  normal  0.0675477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1097  hypothetical protein  43.72 
 
 
201 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0275723  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2951  hypothetical protein  44.56 
 
 
203 aa  158  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3641  hypothetical protein  45.08 
 
 
203 aa  158  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1492  hypothetical protein  45.45 
 
 
187 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3203  hypothetical protein  43.22 
 
 
204 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.95995  normal  0.0207105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1487  hypothetical protein  42.93 
 
 
198 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0947  hypothetical protein  43.94 
 
 
199 aa  148  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3983  hypothetical protein  40.61 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000946307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3355  hypothetical protein  41.71 
 
 
198 aa  135  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2463  hypothetical protein  39.09 
 
 
212 aa  131  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0200  hypothetical protein  43.15 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3444  hypothetical protein  36.71 
 
 
207 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.220732  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2753  hypothetical protein  36.36 
 
 
214 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2786  hypothetical protein  31.4 
 
 
210 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00487472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0245  hypothetical protein  42.42 
 
 
204 aa  99.4  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3941  hypothetical protein  46.34 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000387144  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0323  hypothetical protein  42.65 
 
 
203 aa  94.7  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3021  hypothetical protein  36.27 
 
 
206 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.214048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1008  hypothetical protein  41.67 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2252  hypothetical protein  38.36 
 
 
209 aa  91.7  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1867  hypothetical protein  33.18 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2212  hypothetical protein  33.18 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.625381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1661  hypothetical protein  31.19 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1726  hypothetical protein  31.02 
 
 
188 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1935  hypothetical protein  35.96 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1191  hypothetical protein  34.44 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0273  hypothetical protein  31.22 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.172532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02357  hypothetical protein  39.32 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3242  hypothetical protein  39.17 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3070  hypothetical protein  29.82 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>