20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5414 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5414  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  180  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4381  hypothetical protein  42.17 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.735891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0234  hypothetical protein  45.57 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0176  hypothetical protein  45.57 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2786  hypothetical protein  41.46 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.758487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1870  hypothetical protein  36.25 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000823152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2566  hypothetical protein  41.25 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021382  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0631  hypothetical protein  39.24 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4810  hypothetical protein  38.37 
 
 
87 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0802082  hitchhiker  0.00240732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6355  hypothetical protein  36.71 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4119  hypothetical protein  39.29 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0032  hypothetical protein  34.52 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7049  hypothetical protein  34.52 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0979561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1936  hypothetical protein  35.71 
 
 
92 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.526539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3462  hypothetical protein  36.59 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.438272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2212  hypothetical protein  35.71 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7138  hypothetical protein  36.9 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1827  hypothetical protein  37.68 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4320  hypothetical protein  38.24 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2294  hypothetical protein  33.85 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00328626  hitchhiker  0.00199724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>