10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4566 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3673    100 
 
 
868 bp  1721    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4040    100 
 
 
868 bp  1721    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4566    100 
 
 
868 bp  1721    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4722  IS4 family transposase  100 
 
 
699 bp  1386    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4916    95.32 
 
 
534 bp  852    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4945  transposase  95.12 
 
 
492 bp  785    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4964  transposase  95.12 
 
 
492 bp  785    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0783623 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4917    96.7 
 
 
333 bp  573  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4944    91.6 
 
 
393 bp  517  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4963    91.33 
 
 
369 bp  478  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0787725 
 
 
-
 
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