65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2412 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2412  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  260  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2023  hypothetical protein  83.06 
 
 
124 aa  224  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.616879  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1928  hypothetical protein  70.43 
 
 
118 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0221978 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1977  hypothetical protein  65.29 
 
 
124 aa  176  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3309  hypothetical protein  69.49 
 
 
120 aa  176  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2707  hypothetical protein  64.23 
 
 
128 aa  170  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0125  hypothetical protein  61.54 
 
 
119 aa  158  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5501  Protein of unknown function DUF2237  64.55 
 
 
122 aa  156  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.987798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2456  hypothetical protein  59.83 
 
 
124 aa  156  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3653  hypothetical protein  59.32 
 
 
124 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000473642  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0685  hypothetical protein  58.47 
 
 
122 aa  155  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4999  hypothetical protein  61.21 
 
 
126 aa  154  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1220  hypothetical protein  60.87 
 
 
124 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0467  hypothetical protein  60 
 
 
133 aa  153  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1528  hypothetical protein  61.95 
 
 
124 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.808654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2962  hypothetical protein  61.74 
 
 
133 aa  150  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3433  Protein of unknown function DUF2237  56.91 
 
 
135 aa  150  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0828  hypothetical protein  56.9 
 
 
122 aa  149  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1242  Protein of unknown function DUF2237  58.62 
 
 
124 aa  149  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0254718  normal  0.990114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1932  hypothetical protein  60.34 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251058  normal  0.599919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2396  hypothetical protein  57.89 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0142528  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0946  hypothetical protein  60.18 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541769  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1262  hypothetical protein  60.87 
 
 
124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1957  hypothetical protein  60.18 
 
 
131 aa  143  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.885386 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0643  hypothetical protein  55.86 
 
 
129 aa  141  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3590  hypothetical protein  58.82 
 
 
128 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2959  hypothetical protein  54.78 
 
 
136 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1812  hypothetical protein  51.28 
 
 
128 aa  140  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0739219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0675  hypothetical protein  52.59 
 
 
129 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09571  hypothetical protein  53.45 
 
 
128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.665761  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11601  hypothetical protein  54.39 
 
 
119 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0550185 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1352  hypothetical protein  52.1 
 
 
131 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.412506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3279  hypothetical protein  53.85 
 
 
124 aa  137  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.787383  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0895  hypothetical protein  55.12 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0352424  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1530  hypothetical protein  52.21 
 
 
125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.615056  normal  0.187499 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01011  hypothetical protein  56.03 
 
 
120 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.889214  normal  0.906931 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0062  hypothetical protein  54.24 
 
 
133 aa  136  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.521251  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1527  hypothetical protein  53.1 
 
 
125 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0175588  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4893  Protein of unknown function DUF2237  56.14 
 
 
135 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5045  hypothetical protein  52.14 
 
 
130 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.638609  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5338  hypothetical protein  52.14 
 
 
130 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2475  hypothetical protein  54.62 
 
 
148 aa  135  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4957  hypothetical protein  52.14 
 
 
130 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140635  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08891  hypothetical protein  52.21 
 
 
126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0835358  hitchhiker  0.00000698195 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09861  hypothetical protein  51.72 
 
 
127 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1402  hypothetical protein  55.17 
 
 
119 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2585  Protein of unknown function DUF2237  54.7 
 
 
129 aa  134  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406213  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09841  hypothetical protein  50.86 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0853577  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3965  hypothetical protein  50.89 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517461  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3888  hypothetical protein  59.46 
 
 
132 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.99791 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0925  hypothetical protein  50.86 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0162536  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3584  hypothetical protein  55.17 
 
 
124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.606008  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3269  hypothetical protein  55.17 
 
 
123 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.130768 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1300  hypothetical protein  52.21 
 
 
123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0841  Protein of unknown function DUF2237  52.14 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5781  hypothetical protein  52.14 
 
 
128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1049  hypothetical protein  51.28 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1126  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  124  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164589  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3740  hypothetical protein  48.72 
 
 
133 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0832367  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34675  predicted protein  47.2 
 
 
158 aa  120  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.675349  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1408  Protein of unknown function DUF2237  49.12 
 
 
179 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00658  hypothetical protein  54.39 
 
 
121 aa  116  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1564  hypothetical protein  43.1 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1392  hypothetical protein  57.69 
 
 
83 aa  94.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13777  hypothetical protein  53.12 
 
 
70 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.357939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>