26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1514 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1514  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  30.95 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  30.95 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  30 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  30.95 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  30.95 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  30.95 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  30.95 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4127  hypothetical protein  32.18 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0537  hypothetical protein  30.65 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1016  hypothetical protein  30.65 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0879  hypothetical protein  32.16 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0891  hypothetical protein  32.16 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0975  hypothetical protein  31.66 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0629475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3067  putative transmembrane lipoprotein  30.26 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2379  hypothetical protein  31.37 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323215  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1941  lipoprotein transmembrane  28.57 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.0186336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  30.05 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  28.44 
 
 
223 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2264  putative lipoprotein transmembrane  28.1 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0186714  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2124  lipoprotein transmembrane  30.65 
 
 
213 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167848  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0589  hypothetical protein  29.63 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29516  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0687  putative transmembrane lipoprotein  31.28 
 
 
233 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0877  hypothetical protein  28.85 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1114  hypothetical protein  22.79 
 
 
209 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2339  hypothetical protein  27.23 
 
 
217 aa  42.4  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.039929  normal  0.763516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>