16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7049 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7049  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0979561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0032  hypothetical protein  95.29 
 
 
86 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4119  hypothetical protein  82.35 
 
 
85 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2212  hypothetical protein  48.24 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1936  hypothetical protein  47.06 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.526539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3462  hypothetical protein  42.86 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.438272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0631  hypothetical protein  44.05 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1827  hypothetical protein  43.53 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6355  hypothetical protein  39.76 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7138  hypothetical protein  39.76 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1870  hypothetical protein  37.65 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000823152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2566  hypothetical protein  38.1 
 
 
85 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021382  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4381  hypothetical protein  40.7 
 
 
84 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.735891 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5414  hypothetical protein  34.52 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4810  hypothetical protein  40.23 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0802082  hitchhiker  0.00240732 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2786  hypothetical protein  40.3 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.758487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>