30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5654 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5654  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.784344  normal  0.715221 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1080  hypothetical protein  82.56 
 
 
86 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258722  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5122  hypothetical protein  61.25 
 
 
83 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.811934  normal  0.52075 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6354  hypothetical protein  54.55 
 
 
92 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.302865 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4363  hypothetical protein  51.16 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.60678  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4004  hypothetical protein  51.16 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719576  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5991  hypothetical protein  51.16 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.982912  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1657  hypothetical protein  48.84 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148111  normal  0.110028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3772  hypothetical protein  48.84 
 
 
109 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.685577  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4258  hypothetical protein  48.84 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357148  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4246  hypothetical protein  48.84 
 
 
109 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0400746  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4935  hypothetical protein  46.27 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3225  hypothetical protein  46.27 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0810  hypothetical protein  38.89 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.298574 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3918  hypothetical protein  42.25 
 
 
112 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4716  hypothetical protein  49.15 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110015  normal  0.0160912 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4492  hypothetical protein  55.81 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3206  hypothetical protein  41.56 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  45.83 
 
 
105 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5161  hypothetical protein  41.89 
 
 
91 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961668  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  47.92 
 
 
105 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5118  hypothetical protein  40.54 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3494  hypothetical protein  44.62 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274336  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  42.19 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  45.31 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5082  hypothetical protein  44.83 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516272  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4557  hypothetical protein  44.83 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36871  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0468  hypothetical protein  44.83 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  40.28 
 
 
116 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4392  hypothetical protein  51.06 
 
 
94 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>