66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1739 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1739  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2498  hypothetical protein  88.24 
 
 		 153 aa  271  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.773133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1655  hypothetical protein  86.17 
 
 		 95 aa  167  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164862  normal  0.0707338 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0803  hypothetical protein  53.49 
 
 		 95 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0894  hypothetical protein  53.49 
 
 		 95 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0109048  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2162  hypothetical protein  53.49 
 
 		 95 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5300  hypothetical protein  53.85 
 
 		 118 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201928  normal  0.0485043 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1816  hypothetical protein  53.49 
 
 		 95 aa  90.5  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4352  hypothetical protein  52.75 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6002  hypothetical protein  52.75 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4015  hypothetical protein  52.75 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5440  hypothetical protein  50.55 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1668  hypothetical protein  55.17 
 
 		 94 aa  87  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0906976  normal  0.195021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1116  periplasmic protein of unknown function, DUF1488  52.87 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1226  hypothetical protein  53.33 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.041261  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0762  hypothetical protein  53.33 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1152  hypothetical protein  53.33 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142088  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1166  hypothetical protein  50.55 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.131799 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0701  hypothetical protein  53.33 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154086  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3425  hypothetical protein  48.84 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580024 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2426  hypothetical protein  53.33 
 
 		 336 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1076  hypothetical protein  48.84 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389071  normal  0.0379676 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1572  hypothetical protein  53.93 
 
 		 172 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132989  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3761  hypothetical protein  52.87 
 
 		 97 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4235  hypothetical protein  52.87 
 
 		 92 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0848458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1843  periplasmic protein of unknown function, DUF1488  50.57 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5658  hypothetical protein  46.51 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.959397 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3643  hypothetical protein  47.67 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5586  periplasmic protein of unknown function, DUF1488  47.13 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3390  hypothetical protein  47.67 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0700  hypothetical protein  47.67 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4977  hypothetical protein  47.67 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.511678  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5310  hypothetical protein  47.67 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.995666  normal  0.0457587 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5915  periplasmic protein of unknown function, DUF1488  48.28 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201584  normal  0.705791 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4401  hypothetical protein  45.35 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.157204 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4920  hypothetical protein  45.35 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6317  periplasmic protein of unknown function, DUF1488  48.28 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6186  periplasmic protein of unknown function, DUF1488  45.45 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.786295  normal  0.291736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1512  hypothetical protein  42.05 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3200  hypothetical protein  37.65 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178602  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1141  hypothetical protein  40.7 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1211  hypothetical protein  40.7 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.310364  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1739  protein of unknown function DUF1488  38.64 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0249713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2047  hypothetical protein  38.64 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3345  hypothetical protein  35.63 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00349375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6079  hypothetical protein  49.37 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686391 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6489  hypothetical protein  49.37 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1340  hypothetical protein  49.37 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0203  hypothetical protein  49.23 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488035 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6334  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184436  normal  0.1127 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4511  protein of unknown function DUF1488  40.7 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00806677  normal  0.338754 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4379  hypothetical protein  40.7 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.656996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7025  hypothetical protein  51.9 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5604  hypothetical protein  46.84 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1253  hypothetical protein  42.03 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3584  hypothetical protein  39.13 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5356  hypothetical protein  37.68 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5482  hypothetical protein  43.53 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1187  hypothetical protein  34.83 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00625988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1295  hypothetical protein  34.83 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1961  hypothetical protein  35.42 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0755773  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1633  protein of unknown function DUF1488  36.46 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155163  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1590  hypothetical protein  34.02 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7110  hypothetical protein  36.59 
 
 		 90 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.793169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3575  hypothetical protein  35.21 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000231665  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0226  hypothetical protein  35.71 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>