126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1560 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2921  arginine succinyltransferase  94.8 
 
 
343 aa  671    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.651402  normal  0.342556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1560  arginine N-succinyltransferase  100 
 
 
346 aa  711    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551289  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1159  arginine N-succinyltransferase  80.92 
 
 
343 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26404  normal  0.0654026 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1063  arginine N-succinyltransferase  80.98 
 
 
347 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114093  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0703  arginine N-succinyltransferase  80.92 
 
 
343 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891122  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1063  arginine N-succinyltransferase  81.32 
 
 
348 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1182  arginine N-succinyltransferase  80.92 
 
 
343 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187182  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2122  arginine N-succinyltransferase  80.75 
 
 
348 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653543  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1777  arginine N-succinyltransferase beta subunit  79.48 
 
 
343 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1785  arginine N-succinyltransferase  84.01 
 
 
341 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2845  arginine N-succinyltransferase beta subunit  79.19 
 
 
343 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2725  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  79.48 
 
 
343 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2783  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  79.19 
 
 
343 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0593  arginine N-succinyltransferase, beta chain  79.19 
 
 
343 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4293  arginine succinyltransferase  80.64 
 
 
343 aa  567  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2423  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  79.19 
 
 
343 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.441325  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2868  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  79.19 
 
 
343 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1734  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  79.19 
 
 
343 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.559674  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1869  arginine succinyltransferase  47.2 
 
 
344 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1399  arginine succinyltransferase  47.2 
 
 
344 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.121302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01716  arginine succinyltransferase  47.51 
 
 
344 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1895  arginine N-succinyltransferase  47.51 
 
 
344 aa  330  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.564615  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1416  arginine succinyltransferase  46.9 
 
 
344 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1431  arginine succinyltransferase  46.9 
 
 
344 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.899315  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2465  arginine succinyltransferase  47.51 
 
 
344 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1830  arginine succinyltransferase  47.51 
 
 
344 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01704  hypothetical protein  47.51 
 
 
344 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1885  arginine succinyltransferase  47.51 
 
 
344 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0106586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1444  arginine succinyltransferase  47.51 
 
 
344 aa  330  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.606563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2042  arginine succinyltransferase  46.9 
 
 
344 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825718  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1969  arginine succinyltransferase  47.21 
 
 
344 aa  328  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1994  arginine succinyltransferase  46.63 
 
 
344 aa  325  9e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2843  arginine succinyltransferase  47.35 
 
 
344 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.836294  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1697  arginine succinyltransferase  45.22 
 
 
344 aa  323  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0485  arginine succinyltransferase  47.06 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.468224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3669  arginine N-succinyltransferase  44.31 
 
 
350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.386578  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2806  arginine succinyltransferase  44.81 
 
 
338 aa  311  9e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2519  arginine succinyltransferase  44.57 
 
 
350 aa  300  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2228  arginine succinyltransferase  44.57 
 
 
350 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2120  arginine succinyltransferase  45.13 
 
 
349 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3515  arginine N-succinyltransferase  44.02 
 
 
339 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3317  arginine N-succinyltransferase  42.36 
 
 
361 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0810  arginine N-succinyltransferase  41.52 
 
 
339 aa  288  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3192  arginine N-succinyltransferase  42.11 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0337373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3879  arginine N-succinyltransferase  42.98 
 
 
339 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3696  arginine N-succinyltransferase  42.98 
 
 
339 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3298  arginine N-succinyltransferase  42.86 
 
 
339 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0572  arginine N-succinyltransferase  42.98 
 
 
339 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0656  arginine N-succinyltransferase  41.4 
 
 
339 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.868394  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3010  arginine N-succinyltransferase  44.02 
 
 
339 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3753  arginine N-succinyltransferase  42.69 
 
 
339 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0646  arginine N-succinyltransferase  42.4 
 
 
339 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2194  putative arginine/ornithine succinyltransferase  40.87 
 
 
339 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0635  arginine N-succinyltransferase  40.7 
 
 
338 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1834  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  42.94 
 
 
341 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.860406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0579  arginine N-succinyltransferase  42.27 
 
 
339 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3563  arginine N-succinyltransferase  42.65 
 
 
341 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0612  arginine succinyltransferase  41.52 
 
 
339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0611  arginine succinyltransferase  41.52 
 
 
339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0978523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0618  arginine N-succinyltransferase  41.52 
 
 
339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3418  arginine succinyltransferase  41.52 
 
 
339 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0994163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2909  arginine succinyltransferase  41.86 
 
 
338 aa  268  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.633986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4283  arginine succinyltransferase  41.59 
 
 
341 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52690  arginine/ornithine succinyltransferase AII subunit  42.06 
 
 
340 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.433336  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002276  arginine N-succinyltransferase  40 
 
 
339 aa  265  8e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1055  arginine N-succinyltransferase  39.53 
 
 
347 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4618  arginine/ornithine succinyltransferase AII subunit  41.76 
 
 
340 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2053  arginine succinyltransferase  42.32 
 
 
344 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00498  arginine N-succinyltransferase  42.41 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00078  arginine N-succinyltransferase  38.55 
 
 
339 aa  256  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3984  arginine N-succinyltransferase  41.35 
 
 
342 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1627  arginine N-succinyltransferase  39.53 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.299273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4479  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  41.06 
 
 
342 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.241866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0650  arginine N-succinyltransferase  37.75 
 
 
344 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1436  arginine N-succinyltransferase  41.06 
 
 
342 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3768  arginine N-succinyltransferase  40.76 
 
 
342 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243261  normal  0.0192708 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0164  arginine N-succinyltransferase  37.21 
 
 
346 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.468749  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2734  arginine N-succinyltransferase  40.12 
 
 
339 aa  250  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34480  arginine N-succinyltransferase  40.18 
 
 
345 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3668  arginine N-succinyltransferase  37.87 
 
 
337 aa  245  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0458765  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0883  arginine succinyltransferase  39.41 
 
 
345 aa  239  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174815  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1665  arginine N-succinyltransferase, beta chain  36.73 
 
 
347 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1940  arginine N-succinyltransferase  37.91 
 
 
330 aa  235  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1671  arginine N-succinyltransferase, beta chain  36.26 
 
 
346 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2202  arginine/ornithine succinyltransferase subunit  38.64 
 
 
334 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2890  arginine N-succinyltransferase  37.61 
 
 
366 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.210367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0528  arginine succinyltransferase  35.5 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3769  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  36.55 
 
 
339 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34490  arginine N-succinyltransferase  36.52 
 
 
338 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1435  arginine N-succinyltransferase  35.96 
 
 
339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2807  arginine succinyltransferase  36.55 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4480  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  35.67 
 
 
339 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.98058  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52700  arginine/ornithine succinyltransferase AI subunit  35.65 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.6133  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4619  arginine/ornithine succinyltransferase AI subunit  35.65 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3985  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  35.09 
 
 
339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2910  arginine succinyltransferase  36.26 
 
 
338 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.500754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3564  arginine N-succinyltransferase  34.21 
 
 
343 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1833  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  34.21 
 
 
343 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3318  arginine N-succinyltransferase  37.1 
 
 
338 aa  210  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1062  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  36.54 
 
 
353 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200119  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>