126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1559 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2922  arginine succinyltransferase  93.47 
 
 
352 aa  670    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1559  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  100 
 
 
352 aa  717    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.758428  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1786  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  83.24 
 
 
350 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2846  arginine N-succinyltransferase beta subunit  81.84 
 
 
352 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1776  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  81.84 
 
 
352 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2726  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  81.84 
 
 
352 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2784  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  81.84 
 
 
352 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0592  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  81.27 
 
 
346 aa  554  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2424  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  81.27 
 
 
346 aa  554  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.1511  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2867  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  81.27 
 
 
346 aa  554  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1735  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  81.27 
 
 
346 aa  554  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.680184  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4292  arginine succinyltransferase  76.64 
 
 
350 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2123  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  76.92 
 
 
350 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.648146  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0702  arginine N-succinyltransferase  75.77 
 
 
355 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1181  arginine N-succinyltransferase  75.77 
 
 
355 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1158  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  75.77 
 
 
355 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266781  normal  0.0623877 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1062  arginine N-succinyltransferase  75.07 
 
 
353 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1062  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  74.86 
 
 
353 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200119  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1435  arginine N-succinyltransferase  47.18 
 
 
339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4480  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  46.88 
 
 
339 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.98058  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1833  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  47.37 
 
 
343 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3564  arginine N-succinyltransferase  47.38 
 
 
343 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3985  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  46.29 
 
 
339 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3769  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  45.99 
 
 
339 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34490  arginine N-succinyltransferase  45.72 
 
 
338 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52700  arginine/ornithine succinyltransferase AI subunit  45.1 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.6133  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4619  arginine/ornithine succinyltransferase AI subunit  45.1 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4284  arginine succinyltransferase  46.47 
 
 
339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.584908  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2910  arginine succinyltransferase  45.4 
 
 
338 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.500754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2054  arginine succinyltransferase  40.41 
 
 
338 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2807  arginine succinyltransferase  41.62 
 
 
354 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3668  arginine N-succinyltransferase  37.46 
 
 
337 aa  225  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0458765  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2519  arginine succinyltransferase  37.54 
 
 
350 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2228  arginine succinyltransferase  37.54 
 
 
350 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2120  arginine succinyltransferase  37.57 
 
 
349 aa  215  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1969  arginine succinyltransferase  36.18 
 
 
344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01716  arginine succinyltransferase  36.18 
 
 
344 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1895  arginine N-succinyltransferase  36.18 
 
 
344 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.564615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01704  hypothetical protein  36.18 
 
 
344 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2465  arginine succinyltransferase  36.18 
 
 
344 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1830  arginine succinyltransferase  36.18 
 
 
344 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2843  arginine succinyltransferase  37.24 
 
 
344 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.836294  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1885  arginine succinyltransferase  36.18 
 
 
344 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0106586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1444  arginine succinyltransferase  36.18 
 
 
344 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.606563 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1055  arginine N-succinyltransferase  33.92 
 
 
347 aa  210  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1431  arginine succinyltransferase  36.28 
 
 
344 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.899315  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1416  arginine succinyltransferase  36.28 
 
 
344 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2042  arginine succinyltransferase  36.28 
 
 
344 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825718  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1399  arginine succinyltransferase  36.28 
 
 
344 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.121302 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1869  arginine succinyltransferase  36.28 
 
 
344 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1697  arginine succinyltransferase  35.59 
 
 
344 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1994  arginine succinyltransferase  35.59 
 
 
344 aa  209  7e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3318  arginine N-succinyltransferase  36.61 
 
 
338 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0635  arginine N-succinyltransferase  34.22 
 
 
338 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0883  arginine succinyltransferase  34.12 
 
 
345 aa  206  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174815  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1940  arginine N-succinyltransferase  34.33 
 
 
330 aa  206  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3669  arginine N-succinyltransferase  33.81 
 
 
350 aa  206  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.386578  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1627  arginine N-succinyltransferase  34.49 
 
 
348 aa  205  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.299273 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00498  arginine N-succinyltransferase  36.69 
 
 
345 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3192  arginine N-succinyltransferase  32.35 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0337373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0810  arginine N-succinyltransferase  33.14 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0650  arginine N-succinyltransferase  32.56 
 
 
344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1834  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  35.29 
 
 
341 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.860406  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1665  arginine N-succinyltransferase, beta chain  30.56 
 
 
347 aa  196  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1159  arginine N-succinyltransferase  35.9 
 
 
343 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26404  normal  0.0654026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2921  arginine succinyltransferase  35.34 
 
 
343 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.651402  normal  0.342556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1063  arginine N-succinyltransferase  35.21 
 
 
348 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52690  arginine/ornithine succinyltransferase AII subunit  37.16 
 
 
340 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.433336  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1063  arginine N-succinyltransferase  35.03 
 
 
347 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114093  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0656  arginine N-succinyltransferase  32.55 
 
 
339 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.868394  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3317  arginine N-succinyltransferase  33.62 
 
 
361 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1671  arginine N-succinyltransferase, beta chain  31.16 
 
 
346 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0703  arginine N-succinyltransferase  35.61 
 
 
343 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1182  arginine N-succinyltransferase  35.61 
 
 
343 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187182  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2122  arginine N-succinyltransferase  35.16 
 
 
348 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653543  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4618  arginine/ornithine succinyltransferase AII subunit  37.16 
 
 
340 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1560  arginine N-succinyltransferase  34.57 
 
 
346 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551289  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3563  arginine N-succinyltransferase  34.12 
 
 
341 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0485  arginine succinyltransferase  34.9 
 
 
344 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.468224  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2194  putative arginine/ornithine succinyltransferase  35.21 
 
 
339 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3010  arginine N-succinyltransferase  33.82 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4283  arginine succinyltransferase  34.8 
 
 
341 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3515  arginine N-succinyltransferase  32.45 
 
 
339 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1777  arginine N-succinyltransferase beta subunit  36.81 
 
 
343 aa  189  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0579  arginine N-succinyltransferase  31.96 
 
 
339 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3768  arginine N-succinyltransferase  34.6 
 
 
342 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243261  normal  0.0192708 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2806  arginine succinyltransferase  33.73 
 
 
338 aa  185  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4479  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  35.19 
 
 
342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.241866 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2845  arginine N-succinyltransferase beta subunit  34.99 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2725  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  34.99 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2783  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  34.99 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472941  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1436  arginine N-succinyltransferase  35.19 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3984  arginine N-succinyltransferase  34.6 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4293  arginine succinyltransferase  35.04 
 
 
343 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2909  arginine succinyltransferase  33.14 
 
 
338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.633986 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0593  arginine N-succinyltransferase, beta chain  34.69 
 
 
343 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2423  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  34.69 
 
 
343 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.441325  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2868  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  34.69 
 
 
343 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1734  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  34.69 
 
 
343 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.559674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3298  arginine N-succinyltransferase  30.64 
 
 
339 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>