30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7683 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7683    100 
 
 
339 bp  672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.51286  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4322  mutator family transposase  86.24 
 
 
1266 bp  97.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70031  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0295  transposase  86.24 
 
 
1266 bp  97.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0407  transposase mutator type  86.05 
 
 
1275 bp  75.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.994637  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0882  transposase mutator type  86.05 
 
 
1275 bp  75.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.031699  normal  0.346969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0981  transposase mutator type  86.05 
 
 
1275 bp  75.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1129    86.05 
 
 
4861 bp  75.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967073  normal  0.0235483 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1130  transposase mutator type  86.05 
 
 
1275 bp  75.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513551 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1277  transposase mutator type  86.05 
 
 
1275 bp  75.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1388  transposase mutator type  86.05 
 
 
1275 bp  75.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1437  transposase mutator type  86.05 
 
 
1275 bp  75.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1810  transposase mutator type  86.05 
 
 
1275 bp  75.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214084  hitchhiker  0.00000000849882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6431    87.67 
 
 
312 bp  73.8  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.030456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0294  transposase mutator type  86.36 
 
 
1311 bp  60  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4276  transposase mutator type  86.36 
 
 
1311 bp  60  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4286  transposase mutator type  86.36 
 
 
1311 bp  60  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4304  transposase mutator type  86.36 
 
 
1311 bp  60  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.26589  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1122  transposase mutator type  86.15 
 
 
1269 bp  58  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.370591  normal  0.143118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0049  transposase mutator type  86.15 
 
 
1269 bp  58  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1721  transposase, mutator type  82.95 
 
 
1254 bp  56  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6425  transposase mutator type  86.44 
 
 
1269 bp  54  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2616  transposase mutator type  86.44 
 
 
1269 bp  54  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.938771  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06390  transposase  83.33 
 
 
1281 bp  52  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00660  transposase  83.33 
 
 
1281 bp  52  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  96.3 
 
 
1755 bp  46.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754963  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1439  transposase, mutator type  88.37 
 
 
1305 bp  46.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5923  transposase, mutator type  88.37 
 
 
1410 bp  46.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383294  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1895  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  96.3 
 
 
1644 bp  46.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5521  transposase, mutator type  88.37 
 
 
1410 bp  46.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.380612 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5208  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  96.3 
 
 
1644 bp  46.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.592335 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>