53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5254 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5254  putative ParB-like nuclease  100 
 
 
203 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0513173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2350  Putative ParB-like nuclease  56.25 
 
 
199 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309294  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2187  putative ParB-like nuclease  39.06 
 
 
205 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0352754  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2214  hypothetical protein  39.38 
 
 
198 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189524  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0706  hypothetical protein  41.49 
 
 
218 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0154953  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3524  hypothetical protein  41.49 
 
 
208 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3351  hypothetical protein  39.15 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789599  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0704  hypothetical protein  40.1 
 
 
205 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15967  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2235  Putative ParB-like nuclease  39.58 
 
 
207 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2525  hypothetical protein  38.14 
 
 
208 aa  134  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0224585  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1030  hypothetical protein  38.66 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.738741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1759  hypothetical protein  38.66 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342395  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0136  hypothetical protein  38.66 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1788  hypothetical protein  38.66 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1809  hypothetical protein  38.66 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1271  hypothetical protein  38.66 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335245  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0740  Putative ParB-like nuclease  38.42 
 
 
205 aa  131  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1961  hypothetical protein  39.36 
 
 
443 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4374  hypothetical protein  38.07 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.093636  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0701  Putative ParB-like nuclease  37.89 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0727  putative ParB-like nuclease  37.89 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.881395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0880  Putative ParB-like nuclease  35.2 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4261  putative ParB-like nuclease  36.46 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1716  putative ParB-like nuclease  36.51 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4518  putative ParB-like nuclease  35.42 
 
 
208 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1058  hypothetical protein  35.98 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4678  hypothetical protein  36.51 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0352084  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1460  putative ParB-like nuclease  34.87 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1538  hypothetical protein  35.98 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1420  hypothetical protein  34.87 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1514  putative ParB-like nuclease  35.45 
 
 
208 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  hitchhiker  0.00751547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2660  putative ParB-like nuclease  34.87 
 
 
212 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683597  normal  0.548694 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4378  hypothetical protein  36.68 
 
 
217 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1668  hypothetical protein  34.01 
 
 
206 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0409439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4955  hypothetical protein  34.02 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56990  hypothetical protein  32.47 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0887  hypothetical protein  24.74 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0974  hypothetical protein  27.72 
 
 
222 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05691  hypothetical protein  22.4 
 
 
255 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.222417  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13631  hypothetical protein  27.5 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93854  predicted protein  29.34 
 
 
340 aa  55.1  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00630097  normal  0.0600499 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3409  putative lipoprotein  29.13 
 
 
380 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2351  putative lipoprotein  29.13 
 
 
380 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0264  putative lipoprotein  29.13 
 
 
380 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1126  putative lipoprotein  29.13 
 
 
380 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3368  putative lipoprotein  29.13 
 
 
380 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3403  putative lipoprotein  29.13 
 
 
380 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2530  putative lipoprotein  29.13 
 
 
380 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1245  putative lipoprotein  28.64 
 
 
380 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0653  putative ParB-like nuclease  30.3 
 
 
378 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488055  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3772  hypothetical protein  30.3 
 
 
378 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0203  hypothetical protein  30.3 
 
 
378 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0686  hypothetical protein  30.3 
 
 
378 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>