20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4566 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4566  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  197  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505974  normal  0.611837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2710  hypothetical protein  72.04 
 
 
94 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1413  hypothetical protein  70.97 
 
 
94 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0557  hypothetical protein  65.93 
 
 
94 aa  131  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2099  hypothetical protein  57.14 
 
 
95 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.352052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3473  hypothetical protein  59.34 
 
 
94 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415085  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5398  hypothetical protein  57.78 
 
 
93 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0062  hypothetical protein  55.43 
 
 
93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.143041 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7582  hypothetical protein  51.65 
 
 
92 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.870331  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2624  hypothetical protein  50.54 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1240  hypothetical protein  50 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3077  hypothetical protein  57.89 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1997  hypothetical protein  48.94 
 
 
95 aa  91.3  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2057  hypothetical protein  48.39 
 
 
114 aa  88.2  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1112  hypothetical protein  39.77 
 
 
93 aa  81.3  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.358741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4692  hypothetical protein  43.01 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1764  hypothetical protein  34.41 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.556792  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13171  hypothetical protein  41.1 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1223  hypothetical protein  50.82 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4747  hypothetical protein  35.48 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0684106  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>