22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3883 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3883  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372764  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4289  membrane-bound metal-dependent hydrolase  70.83 
 
 
171 aa  200  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.208948 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3376  membrane-bound metal-dependent hydrolase  64.24 
 
 
182 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3699  hypothetical protein  62.42 
 
 
182 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0618  hypothetical protein  71.6 
 
 
172 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0268751 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3592  hypothetical protein  65.82 
 
 
174 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4594  hypothetical protein  62.57 
 
 
174 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238145  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4415  hypothetical protein  66.46 
 
 
174 aa  180  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1851  hypothetical protein  67.33 
 
 
174 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.163042 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4067  hypothetical protein  64.56 
 
 
174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0208636  normal  0.9668 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4186  hypothetical protein  65.82 
 
 
174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.48428  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4180  hypothetical protein  65.82 
 
 
174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.84562  normal  0.337483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3337  hypothetical protein  65.82 
 
 
174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1133  hypothetical protein  65.25 
 
 
172 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0372  hypothetical protein  65.96 
 
 
172 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0329059  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0267  hypothetical protein  65.96 
 
 
172 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1826  hypothetical protein  65.96 
 
 
172 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437082  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1329  hypothetical protein  65.96 
 
 
172 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0300  hypothetical protein  65.96 
 
 
172 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.861833  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0995  hypothetical protein  65.96 
 
 
172 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0588221  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1741  hypothetical protein  65.25 
 
 
172 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631778  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4474  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.34 
 
 
153 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>