23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1313 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1313  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1523  hypothetical protein  68.66 
 
 
217 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1294  hypothetical protein  68.66 
 
 
217 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3288  hypothetical protein  68.66 
 
 
217 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0072457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2023  hypothetical protein  68.66 
 
 
217 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.425891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2456  hypothetical protein  58.01 
 
 
217 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2404  hypothetical protein  68.66 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267711  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2430  hypothetical protein  51.46 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.283363 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1707  hypothetical protein  81.48 
 
 
242 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1990  hypothetical protein  48.36 
 
 
202 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6087  hypothetical protein  48.36 
 
 
202 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2010  hypothetical protein  43.33 
 
 
199 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824797  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2023  hypothetical protein  57.78 
 
 
199 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2547  hypothetical protein  66.67 
 
 
194 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5300  hypothetical protein  52.91 
 
 
201 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.693609  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1892  hypothetical protein  44.33 
 
 
199 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1286  hypothetical protein  60 
 
 
197 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0405669  normal  0.365164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2057  hypothetical protein  65.77 
 
 
183 aa  131  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1430  hypothetical protein  41.07 
 
 
192 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.011317  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1307  putative transmembrane protein  42.96 
 
 
192 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0447673  normal  0.727033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1371  hypothetical protein  42.96 
 
 
192 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108082  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1855  transmembrane protein  41.62 
 
 
207 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1462  hypothetical protein  40 
 
 
213 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.499251  normal  0.378449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>