17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1004 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1004  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  226  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794085  normal  0.470694 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1880  hypothetical protein  67.86 
 
 
109 aa  140  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.470646  normal  0.235598 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2306  hypothetical protein  62.5 
 
 
114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0978479  normal  0.872005 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5248  hypothetical protein  50.49 
 
 
92 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309279  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1925  hypothetical protein  52.43 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.294161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1852  hypothetical protein  51.46 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0603448  hitchhiker  0.000139729 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6142  hypothetical protein  50.49 
 
 
92 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1937  hypothetical protein  50.49 
 
 
92 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.222522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1334  hypothetical protein  49.51 
 
 
92 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0626491  decreased coverage  0.000050707 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1961  hypothetical protein  50.49 
 
 
92 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133312  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2095  hypothetical protein  93.94 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.973371  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1978  hypothetical protein  93.94 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0228206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3327  hypothetical protein  93.94 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000856601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2350  hypothetical protein  93.94 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2393  hypothetical protein  93.94 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1251  hypothetical protein  93.94 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2506  hypothetical protein  93.94 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>