57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2796 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2796  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  100 
 
 
270 aa  551  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0513  S-adenosylmethionine decarboxylase  65.3 
 
 
271 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0527  S-adenosylmethionine decarboxylase  64.93 
 
 
271 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2244  S-adenosylmethionine decarboxylase  60.08 
 
 
273 aa  344  7e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.868188  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2078  S-adenosylmethionine decarboxylase  60.3 
 
 
292 aa  340  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1749  S-adenosylmethionine decarboxylase  59.25 
 
 
279 aa  330  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3552  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.77 
 
 
263 aa  329  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4575  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.52 
 
 
264 aa  328  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0913  S-adenosylmethionine decarboxylase  59.4 
 
 
264 aa  328  7e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0795  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.52 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2355  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  58.56 
 
 
269 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2794  S-adenosylmethionine decarboxylase  59.32 
 
 
271 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0123327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0598  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  57.14 
 
 
264 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08390  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.14 
 
 
264 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000233299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46080  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.77 
 
 
264 aa  325  7e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0878  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.56 
 
 
264 aa  323  1e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00026083  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3714  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.41 
 
 
264 aa  322  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17268  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0791  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.17 
 
 
264 aa  321  7e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5109  S-adenosylmethionine decarboxylase  55.26 
 
 
264 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04007  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.03 
 
 
264 aa  319  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0197  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.56 
 
 
264 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0184  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.56 
 
 
264 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.877989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0181  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.56 
 
 
264 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.515006  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0180  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.56 
 
 
264 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0189  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.56 
 
 
264 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.409769  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1015  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.17 
 
 
264 aa  313  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00118  hypothetical protein  58.56 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3482  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  58.56 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000023207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0113  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.56 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0127  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.56 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736728  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3539  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.56 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206954  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00119  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  58.56 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00015961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0124  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.56 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0122  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.56 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0933555  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0130  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.56 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.274606  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2837  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.17 
 
 
264 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0668  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.41 
 
 
264 aa  309  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000040658  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1024  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.41 
 
 
264 aa  308  9e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3483  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.41 
 
 
264 aa  308  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000055229  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3355  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.41 
 
 
264 aa  308  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000217345  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0737  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  56.39 
 
 
276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000135532  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0951  S-adenosylmethionine decarboxylase  53.41 
 
 
276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1235  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.34 
 
 
276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000212775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4002  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.27 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3130  S-adenosylmethionine decarboxylase  55.89 
 
 
264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0630  S-adenosylmethionine decarboxylase  41.13 
 
 
252 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5302  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  27.34 
 
 
123 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000919231 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4906  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.36 
 
 
123 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5446  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.36 
 
 
123 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4891  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.58 
 
 
123 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5061  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.36 
 
 
123 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5333  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.78 
 
 
123 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5626  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.78 
 
 
123 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000593222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5378  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25 
 
 
123 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1085  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.36 
 
 
129 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000176984  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1388  S-adenosylmethionine decarboxylase related  23.62 
 
 
168 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1455  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.22 
 
 
126 aa  42.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>