47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2842 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2628  double-transmembrane region  49.26 
 
 		 937 aa  746    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3058  hypothetical protein  40.63 
 
 		 937 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0693886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5169  hypothetical protein  52.45 
 
 		 939 aa  828    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1734  hypothetical protein  52.05 
 
 		 945 aa  832    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.093784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2794  hypothetical protein  40.71 
 
 		 937 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.749604  normal  0.246775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1374  hypothetical protein  47.26 
 
 		 941 aa  765    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1454  hypothetical protein  51.41 
 
 		 943 aa  817    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332859  normal  0.622098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2842  hypothetical protein  100 
 
 		 939 aa  1862    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4482  hypothetical protein  52.05 
 
 		 941 aa  816    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.792341  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3637  hypothetical protein  51.62 
 
 		 939 aa  813    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504486  normal  0.363104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1457  hypothetical protein  52.05 
 
 		 945 aa  829    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.109883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2946  hypothetical protein  48.73 
 
 		 943 aa  764    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575307  normal  0.59944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2232  hypothetical protein  47.96 
 
 		 939 aa  689    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1607  hypothetical protein  41.83 
 
 		 957 aa  667    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557026  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1506  hypothetical protein  42.74 
 
 		 948 aa  667    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.446295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2269  hypothetical protein  48.01 
 
 		 940 aa  778    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_004310  BR1558  hypothetical protein  42.8 
 
 		 949 aa  664    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1190  double-transmembrane region-like  47.1 
 
 		 941 aa  748    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0914  double-transmembrane region-like  48.81 
 
 		 958 aa  771    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1293  double-transmembrane region-like  47.58 
 
 		 941 aa  783    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.397525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3253  double-transmembrane region-like  48 
 
 		 938 aa  744    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.331442  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2181  hypothetical protein  42.96 
 
 		 942 aa  635  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647375  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3232  hypothetical protein  41.35 
 
 		 942 aa  629  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.708508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2277  hypothetical protein  42.17 
 
 		 937 aa  626  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30304  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1009  hypothetical protein  37.27 
 
 		 932 aa  537  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.479574  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0723  hypothetical protein  39.98 
 
 		 914 aa  526  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2769  double-transmembrane region-like  38.26 
 
 		 929 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.676495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0205  hypothetical protein  39.1 
 
 		 921 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.556354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0685  double-transmembrane region-like  38.31 
 
 		 919 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.621898  normal  0.74897 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2683  hypothetical protein  38.51 
 
 		 925 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.574694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1022  hypothetical protein  38.73 
 
 		 925 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.52068  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0371  double-transmembrane region-like  37.68 
 
 		 927 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3011  hypothetical protein  37.37 
 
 		 940 aa  436  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0470546  normal  0.329062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 892 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2904  hypothetical protein  39.34 
 
 		 924 aa  296  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.365436 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3903  hypothetical protein  37.52 
 
 		 639 aa  294  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.436608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3904  hypothetical protein  44.57 
 
 		 279 aa  204  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1222  hypothetical protein  33.94 
 
 		 256 aa  88.2  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2547  hypothetical protein  33.48 
 
 		 255 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4089  hypothetical protein  34.36 
 
 		 280 aa  87  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.0383988 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2738  hypothetical protein  33.94 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2644  hypothetical protein  33.94 
 
 		 256 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0827849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  32 
 
 		 710 aa  54.3  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4265  double-transmembrane region  28.38 
 
 		 717 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4421  hypothetical protein  29.02 
 
 		 717 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4400  hypothetical protein  29.02 
 
 		 717 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4420  hypothetical protein  26.92 
 
 		 720 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>