22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2630 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2630    100 
 
 		 225 bp  446  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1610    89.66 
 
 		 167 bp  101  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.382467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2781    88.68 
 
 		 579 bp  58  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  94.29 
 
 		 594 bp  54  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  88 
 
 		 960 bp  52  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  88 
 
 		 960 bp  52  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  88 
 
 		 960 bp  52  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  88 
 
 		 513 bp  52  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  88 
 
 		 960 bp  52  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  93.75 
 
 		 387 bp  48.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4284    93.75 
 
 		 980 bp  48.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0676    93.75 
 
 		 1031 bp  48.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495528 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  93.75 
 
 		 993 bp  48.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  93.75 
 
 		 993 bp  48.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  93.75 
 
 		 1068 bp  48.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  93.75 
 
 		 1047 bp  48.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  93.75 
 
 		 993 bp  48.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2676    93.75 
 
 		 672 bp  48.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  0.345661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  93.75 
 
 		 993 bp  48.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2747    93.75 
 
 		 1062 bp  48.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0487379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  93.75 
 
 		 993 bp  48.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2536    87.23 
 
 		 950 bp  46.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>