18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2572 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2572    100 
 
 		 99 bp  196  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  100 
 
 		 567 bp  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2536    89.23 
 
 		 950 bp  73.8  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  87.69 
 
 		 912 bp  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1952    86.15 
 
 		 2579 bp  58  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  84.38 
 
 		 984 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  84.38 
 
 		 951 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  84.38 
 
 		 966 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  84.38 
 
 		 951 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  84.38 
 
 		 951 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  84.38 
 
 		 951 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  84.38 
 
 		 951 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  84.38 
 
 		 951 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  84.38 
 
 		 990 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  84.38 
 
 		 951 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  84.38 
 
 		 951 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  84.38 
 
 		 990 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4264    86.27 
 
 		 234 bp  46.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.996323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>