24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2565 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2565  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  332  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1252  hypothetical protein  35.03 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.500824  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1138  hypothetical protein  27.34 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.558369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2755  hypothetical protein  27.34 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2911  hypothetical protein  27.34 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0499229  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0312  hypothetical protein  27.34 
 
 
192 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00457617  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0405  hypothetical protein  28.26 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0691  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.17 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.979336  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0575  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.64 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0962204  hitchhiker  0.00000348554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4371  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.3 
 
 
149 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.732633  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0451  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.28 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333095  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6124  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.42 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430831  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.61 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4618  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.28 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04936  hypothetical protein  25 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0743  hypothetical protein  29.03 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1236  hypothetical protein  24.62 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4252  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.7 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4350  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.09 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.300431 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0373  hypothetical protein  29.06 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1094  hypothetical protein  24.62 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171827  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0478  hypothetical protein  24.62 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0528952  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0205  hypothetical protein  24.62 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.26 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>