23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2135 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2135  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  308  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0076  hypothetical protein  56.83 
 
 
168 aa  163  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3527  hypothetical protein  55.4 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1372  hypothetical protein  41.83 
 
 
161 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2092  hypothetical protein  39.57 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46310  hypothetical protein  37.04 
 
 
145 aa  98.6  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123911  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2149  hypothetical protein  39.53 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13970  hypothetical protein  36.81 
 
 
211 aa  94  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.607556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3765  hypothetical protein  35 
 
 
146 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0925  hypothetical protein  39.83 
 
 
118 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2280  hypothetical protein  36.17 
 
 
142 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2467  hypothetical protein  35.04 
 
 
146 aa  86.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1403  hypothetical protein  38.35 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628547  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2062  hypothetical protein  39.37 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0457353  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4776  hypothetical protein  33.81 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  35.92 
 
 
418 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3329  hypothetical protein  33.58 
 
 
142 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0342  hypothetical protein  29.1 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3607  hypothetical protein  31.21 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.9799  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0392  hypothetical protein  32.12 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.2643  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1294  hypothetical protein  33.1 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1455  hypothetical protein  28.91 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0296741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4495  hypothetical protein  29.63 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>