21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1562 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1562  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  187  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0374  hypothetical protein  43.37 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.403267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4459  hypothetical protein  45.57 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218625  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3000  hypothetical protein  39.33 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3337  hypothetical protein  48.24 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3225  hypothetical protein  39.33 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1889  hypothetical protein  39.76 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2383  hypothetical protein  42.05 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0573572  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3071  hypothetical protein  42.05 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0905739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2241  hypothetical protein  43.21 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3189  hypothetical protein  38.2 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2744  hypothetical protein  43.37 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.461077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3569  hypothetical protein  44.58 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3333  hypothetical protein  39.53 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1707  hypothetical protein  41.98 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123463  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2430  hypothetical protein  47.06 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213345  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0961  hypothetical protein  35.63 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.570752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1931  hypothetical protein  40.85 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154345  hitchhiker  0.0000000596513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0557  hypothetical protein  38.57 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2903  hypothetical protein  30.68 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.520139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2220  hypothetical protein  32.5 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>