29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16060 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_16060  Protein of unknown function (DUF2581)  100 
 
 
154 aa  309  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.199919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2992  hypothetical protein  40.88 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.10835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2837  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  90.9  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36145  normal  0.0579285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1082  hypothetical protein  36.03 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1732  hypothetical protein  37.59 
 
 
153 aa  84  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0454052  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11446  hypothetical protein  35.56 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0232943  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1376  hypothetical protein  39.42 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.486937 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0863  Protein of unknown function DUF2581  37.93 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17667  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2392  hypothetical protein  38.95 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142934  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2439  hypothetical protein  38.95 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2433  hypothetical protein  38.95 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.504419  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1864  Protein of unknown function DUF2581  37.62 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0408425  normal  0.232813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2696  hypothetical protein  34.31 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18200  Protein of unknown function (DUF2581)  41.67 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3113  hypothetical protein  30.87 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272231  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1881  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0884848  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2453  hypothetical protein  40.2 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3717  hypothetical protein  36.08 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.668266  normal  0.103585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5216  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1874  hypothetical protein  33.58 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2974  hypothetical protein  35.19 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26731  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15750  Protein of unknown function (DUF2581)  31.9 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3051  hypothetical protein  36.89 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2559  Protein of unknown function DUF2581  29.93 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.260475  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2055  hypothetical protein  34.65 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12800  Protein of unknown function (DUF2581)  32.19 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0224301  decreased coverage  0.00565206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4149  hypothetical protein  29.33 
 
 
214 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.638861  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2357  Protein of unknown function DUF2581  31.79 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3040  Protein of unknown function DUF2581  38.03 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>