83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0877 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0877  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 
284 aa  585  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1274  hypothetical protein  89.79 
 
 
284 aa  530  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1319  hypothetical protein  89.79 
 
 
284 aa  530  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.270285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1082  hypothetical protein  90.14 
 
 
284 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1065  hypothetical protein  90.14 
 
 
284 aa  532  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1060  hypothetical protein  90.14 
 
 
284 aa  532  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1167  hypothetical protein  90.14 
 
 
284 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1241  hypothetical protein  90.14 
 
 
284 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1214  hypothetical protein  88.73 
 
 
284 aa  528  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4127  hypothetical protein  88.73 
 
 
284 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.098552  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1062  RNA-binding S1 domain-containing protein  85.92 
 
 
284 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425998  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0712  RNA binding S1 domain protein  52.5 
 
 
286 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000721227  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0961  hypothetical protein  37.59 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.93034  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1511  hypothetical protein  39.23 
 
 
284 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00830658  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0883  RNA-binding protein  36.19 
 
 
297 aa  171  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000841553 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0476  RNA-binding protein  38.18 
 
 
299 aa  171  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1452  hypothetical protein  33.94 
 
 
300 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.288819  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1481  hypothetical protein  33.94 
 
 
300 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1301  RNA-binding protein  34.66 
 
 
287 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.237432  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0752  hypothetical protein  33.45 
 
 
293 aa  158  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000115591  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2289  RNA-binding protein  34.91 
 
 
285 aa  157  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0250  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.55 
 
 
279 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000115612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2903  RNA binding S1 domain protein  31.64 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.144767  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1621  hypothetical protein  32.65 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1902  hypothetical protein  32.3 
 
 
280 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000109992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1813  hypothetical protein  32.17 
 
 
277 aa  122  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0500461  normal  0.539487 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16900  RNA binding protein, S1 family  31.75 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49930  hypothetical protein  32.97 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.358542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4253  hypothetical protein  32.97 
 
 
279 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3187  GntR family transcriptional regulator  31.99 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.547241  normal  0.0826379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5129  RNA binding S1 domain protein  30.11 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2473  RNA binding S1 domain protein  29.45 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.728532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4023  hypothetical protein  32.03 
 
 
277 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4021  hypothetical protein  29.1 
 
 
276 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000280354  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11108  hypothetical protein  30.66 
 
 
276 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3786  RNA binding S1  28.21 
 
 
278 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198165  normal  0.0264698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4487  hypothetical protein  29.13 
 
 
284 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.830856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1593  hypothetical protein  28.21 
 
 
278 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2783  hypothetical protein  30.1 
 
 
284 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0117976  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1111  hypothetical protein  28.83 
 
 
298 aa  106  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1966  hypothetical protein  28.04 
 
 
276 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294395  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1623  hypothetical protein  27.94 
 
 
279 aa  106  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1630  hypothetical protein  27.57 
 
 
279 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0406608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1555  hypothetical protein  27.57 
 
 
279 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1813  hypothetical protein  29.12 
 
 
283 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.307669 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0626  hypothetical protein  28.17 
 
 
279 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000762305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1446  RNA binding S1  29.09 
 
 
278 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1514  RNA-binding S1 domain-containing protein  26.74 
 
 
279 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003424  hypothetical protein  26.26 
 
 
277 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.303245  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3864  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.21 
 
 
278 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1452  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.36 
 
 
277 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02354  hypothetical protein  26.98 
 
 
277 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1645  hypothetical protein  28.21 
 
 
280 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0235  hypothetical protein  27.71 
 
 
295 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000105707  hitchhiker  0.0000000000000116702 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1868  hypothetical protein  26.47 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1766  hypothetical protein  28.37 
 
 
280 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.530453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1803  hypothetical protein  28.37 
 
 
280 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.303771  normal  0.460129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2519  hypothetical protein  28.37 
 
 
280 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.830114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1759  hypothetical protein  28.37 
 
 
280 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2281  hypothetical protein  28.36 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.014395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2579  RNA binding S1 domain protein  27.6 
 
 
277 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.401264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2031  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.06 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2136  RNA binding S1 domain protein  26.22 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2080  RNA binding S1 domain protein  26.32 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.56309e-28 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1515  nucleic acid binding protein  28.02 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4563  RNA binding S1 domain protein  27.47 
 
 
278 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1727  yitL protein  25.09 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1518  hypothetical protein  26.16 
 
 
280 aa  93.2  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0135842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1326  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.11 
 
 
278 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4071  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.47 
 
 
278 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1697  hypothetical protein  25.95 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01079  hypothetical protein  28.11 
 
 
305 aa  92.4  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0312  hypothetical protein  25.09 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1618  hypothetical protein  25.37 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.165792  normal  0.0266154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2481  hypothetical protein  26.74 
 
 
277 aa  89.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0367564  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0886  RNA binding S1 domain protein  26.81 
 
 
274 aa  87.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000369657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3240  uncharacterized protein-like protein  25.72 
 
 
280 aa  86.3  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1724  hypothetical protein  26.16 
 
 
301 aa  85.5  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.437519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2056  hypothetical protein  24.01 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00868426  normal  0.106459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0056  RNA binding S1  30.05 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2647  hypothetical protein  25.19 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.902029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2610  hypothetical protein  22.94 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1187  hypothetical protein  30.51 
 
 
151 aa  62.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>