44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1637 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1637  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 		 108 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0741559 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1663  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  95.33 
 
 		 108 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285539  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1183  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  95.33 
 
 		 108 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1581  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  83.33 
 
 		 108 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.285184 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4811  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  86.79 
 
 		 107 aa  191  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1562  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  79.63 
 
 		 108 aa  184  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3428  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.64 
 
 		 107 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7132  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  75 
 
 		 109 aa  167  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0006  hypothetical protein  71.7 
 
 		 107 aa  164  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0720243  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1644  protein tyrosine phosphatase-like protein  63.55 
 
 		 107 aa  150  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.294535  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4802  hypothetical protein  60.75 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1380  hypothetical protein  58.88 
 
 		 107 aa  141  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44960  hypothetical protein  64.49 
 
 		 109 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3825  hypothetical protein  62.62 
 
 		 109 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417534  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3946  phosphatase  60.19 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3461  hypothetical protein  50.94 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3432  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  54.72 
 
 		 106 aa  120  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.284191  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3543  hypothetical protein  54.63 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3038  hypothetical protein  55.77 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.959689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02886  phosphatase  54.9 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2559  phosphatase  52.48 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2810  hypothetical protein  54.81 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.984704 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2603  hypothetical protein  46.6 
 
 		 108 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0718  hypothetical protein  44.86 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2929  hypothetical protein  50.96 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2721  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.71 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.203534  normal  0.0645973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3901  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.34 
 
 		 109 aa  103  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0160871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4974  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.38 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4364  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.76 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal  0.301624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1082  hypothetical protein  45.79 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1113  protein-tyrosine-phosphatase  39.81 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0181  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.92 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0189  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.92 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00160916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0174  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.92 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0497104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0174  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.88 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0119958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1065  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.24 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  30.59 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  31.76 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.94 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.94 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  30.08 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.76 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  30.59 
 
 		 146 aa  40  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  31.76 
 
 		 146 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>