50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0653 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0686  hypothetical protein  98.68 
 
 
378 aa  757    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0653  putative ParB-like nuclease  100 
 
 
378 aa  766    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488055  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0203  hypothetical protein  98.68 
 
 
378 aa  757    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3772  hypothetical protein  94.71 
 
 
378 aa  705    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1245  putative lipoprotein  74.81 
 
 
380 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3368  putative lipoprotein  73.95 
 
 
380 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0264  putative lipoprotein  72.89 
 
 
380 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2530  putative lipoprotein  72.89 
 
 
380 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1126  putative lipoprotein  72.89 
 
 
380 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3409  putative lipoprotein  74.21 
 
 
380 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2351  putative lipoprotein  72.89 
 
 
380 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3403  putative lipoprotein  73.95 
 
 
380 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2067  putative ParB-like nuclease  36.89 
 
 
305 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11851  hypothetical protein  26.01 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4955  hypothetical protein  36.44 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0974  hypothetical protein  27.36 
 
 
222 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4374  hypothetical protein  35.25 
 
 
226 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.093636  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0887  hypothetical protein  26.92 
 
 
222 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4378  hypothetical protein  35.04 
 
 
217 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56990  hypothetical protein  33.05 
 
 
228 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1961  hypothetical protein  33.87 
 
 
443 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3351  hypothetical protein  33.07 
 
 
207 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789599  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1716  putative ParB-like nuclease  28.02 
 
 
208 aa  53.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2350  Putative ParB-like nuclease  34.4 
 
 
199 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309294  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0706  hypothetical protein  32.06 
 
 
218 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0154953  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0701  Putative ParB-like nuclease  25.12 
 
 
205 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2235  Putative ParB-like nuclease  32.28 
 
 
207 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0740  Putative ParB-like nuclease  26.75 
 
 
205 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1271  hypothetical protein  33.87 
 
 
208 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335245  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1030  hypothetical protein  33.87 
 
 
208 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.738741  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1788  hypothetical protein  33.87 
 
 
208 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185204  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0136  hypothetical protein  33.87 
 
 
208 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1809  hypothetical protein  33.87 
 
 
208 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1759  hypothetical protein  33.87 
 
 
208 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0727  putative ParB-like nuclease  26.75 
 
 
205 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.881395 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05691  hypothetical protein  31.5 
 
 
255 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.222417  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4678  hypothetical protein  27.05 
 
 
208 aa  49.7  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0352084  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13631  hypothetical protein  24.52 
 
 
216 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1538  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1058  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1420  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1514  putative ParB-like nuclease  33.33 
 
 
208 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  hitchhiker  0.00751547 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1460  putative ParB-like nuclease  33.33 
 
 
208 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2214  hypothetical protein  31.3 
 
 
198 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189524  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2187  putative ParB-like nuclease  28 
 
 
205 aa  46.6  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0352754  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2525  hypothetical protein  31.75 
 
 
208 aa  46.2  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0224585  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0704  hypothetical protein  29.37 
 
 
205 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3524  hypothetical protein  28.35 
 
 
208 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2660  putative ParB-like nuclease  30.46 
 
 
212 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683597  normal  0.548694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0880  Putative ParB-like nuclease  28.1 
 
 
205 aa  43.9  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141868 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>