9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0212 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0212  VRR-NUC domain-containing protein  100 
 
 
256 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143344  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0643  VRR-NUC domain-containing protein  87.11 
 
 
255 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1357  gp30  47.84 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200548  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2001  gp30  50.64 
 
 
244 aa  188  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274125  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0118  gp30  43.05 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04485  hypothetical protein  36.19 
 
 
231 aa  92.4  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53650  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00626606  hitchhiker  0.000571766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0890  hypothetical protein  39.36 
 
 
334 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.451004  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0702  hypothetical protein  30.61 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>