24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6455 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6455  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  100 
 
 		 102 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6690  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  100 
 
 		 102 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6287  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  98.04 
 
 		 102 aa  205  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  36.56 
 
 		 455 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1013  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  37.5 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3594  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.33 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2764  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  37.5 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2334  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  29.47 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00612684  normal  0.644511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2641  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.33 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.444029  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0686  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  28.16 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.761017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2867  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.33 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.169776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7247  ethyl tert-butyl ether degradation protein, EthD  32.35 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.229987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1972  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.37 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.906613 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2087  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.96 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5990  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.96 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2106  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.37 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.217375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1877  EthD  31.25 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00821  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  30 
 
 		 119 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0976137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4472  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.89 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3681  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  29.9 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.401382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2068  hypothetical protein  31.25 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3503  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  26.53 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0707  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.31 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0206  normal  0.431639 
 
 
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NC_009921  Franean1_1640  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  30.53 
 
 		 111 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
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