23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6087 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6087  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1990  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2010  hypothetical protein  93.56 
 
 
199 aa  348  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824797  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1892  hypothetical protein  82.67 
 
 
199 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2023  hypothetical protein  83.66 
 
 
199 aa  286  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5300  hypothetical protein  78.16 
 
 
201 aa  266  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.693609  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1286  hypothetical protein  78.05 
 
 
197 aa  248  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0405669  normal  0.365164 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1523  hypothetical protein  65.88 
 
 
217 aa  204  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1294  hypothetical protein  65.88 
 
 
217 aa  204  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3288  hypothetical protein  65.88 
 
 
217 aa  204  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0072457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2023  hypothetical protein  65.88 
 
 
217 aa  204  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.425891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2456  hypothetical protein  65.29 
 
 
217 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2404  hypothetical protein  66.47 
 
 
217 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267711  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2547  hypothetical protein  62.59 
 
 
194 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2057  hypothetical protein  55.91 
 
 
183 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2430  hypothetical protein  63.7 
 
 
245 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.283363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1313  hypothetical protein  48.36 
 
 
274 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1707  hypothetical protein  62.96 
 
 
242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1855  transmembrane protein  44.2 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1430  hypothetical protein  37.58 
 
 
192 aa  91.3  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.011317  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1307  putative transmembrane protein  48.35 
 
 
192 aa  88.2  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0447673  normal  0.727033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1371  hypothetical protein  48.35 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108082  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1462  hypothetical protein  37.93 
 
 
213 aa  84.7  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.499251  normal  0.378449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>