22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1874 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1874  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  339  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2485  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  339  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247723  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2510  hypothetical protein  99.4 
 
 
166 aa  337  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5817  hypothetical protein  93.33 
 
 
166 aa  316  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0739002 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0810  hypothetical protein  88.55 
 
 
166 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0053  hypothetical protein  61.73 
 
 
168 aa  211  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3701  hypothetical protein  58.64 
 
 
168 aa  209  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.402351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5150  hypothetical protein  30.19 
 
 
265 aa  62  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953458  normal  0.848827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6824  hypothetical protein  35.33 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4718  hypothetical protein  29.6 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.841461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4719  hypothetical protein  27.19 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164513  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5049  hypothetical protein  31.78 
 
 
268 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3837  hypothetical protein  30.28 
 
 
172 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0455557  normal  0.186197 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0168  hypothetical protein  33.64 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0586014  hitchhiker  0.00159646 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5113  hypothetical protein  31.13 
 
 
268 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3255  hypothetical protein  31.13 
 
 
268 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5168  hypothetical protein  30.19 
 
 
268 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0535047 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0525  hypothetical protein  28.97 
 
 
268 aa  44.3  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0129049  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0982  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  27.01 
 
 
326 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0152771  normal  0.420288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2164  hypothetical protein  26.39 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2954  hypothetical protein  22.66 
 
 
157 aa  41.6  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.231645  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2528  hypothetical protein  28.48 
 
 
161 aa  40.8  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>