72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0172 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  100 
 
 		 176 aa  360  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  100 
 
 		 176 aa  360  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  98.86 
 
 		 183 aa  357  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  93.33 
 
 		 176 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  92.73 
 
 		 177 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  90.85 
 
 		 183 aa  309  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  90.24 
 
 		 183 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  76.58 
 
 		 176 aa  240  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  72.22 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  72.22 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  72.22 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  72.22 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  72.22 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  72.22 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  72.22 
 
 		 176 aa  234  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  67.26 
 
 		 183 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0577  rare lipoprotein B  62.96 
 
 		 169 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3379  rare lipoprotein B  59.15 
 
 		 183 aa  207  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  43.15 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  39.47 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2743  putative lipoprotein B precursor transmembrane  41.26 
 
 		 169 aa  104  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  41.38 
 
 		 175 aa  101  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2572  Rare lipoprotein B  39.44 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.613264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2982  Rare lipoprotein B  39.44 
 
 		 174 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  37.86 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  36.84 
 
 		 168 aa  89.4  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  35.62 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  31.17 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  35.14 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4604  rare lipoprotein B  33.33 
 
 		 168 aa  84.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0759  rare lipoprotein B  32.43 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  31.79 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0423  Rare lipoprotein B  34.25 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0217  putative lipoprotein B precursor  35.1 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4547  rare lipoprotein B  32.65 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3916  rare lipoprotein B  31.54 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3265  Rare lipoprotein B  31.54 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1072  rare lipoprotein B  29.86 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  28.21 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0255  rare lipoprotein B precursor  29.05 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  31.71 
 
 		 201 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0233  rare lipoprotein B precursor  27.78 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0480  rare lipoprotein B  28.06 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  27.52 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  30.67 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0401  rare lipoprotein B-like protein  31.65 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  29.45 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  30.49 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  27.52 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  28.57 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01875  lipoprotein  29.76 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2144  rare lipoprotein B  29.17 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  26.85 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  26.85 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  27.17 
 
 		 201 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  26.85 
 
 		 164 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  28.32 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.88 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  26.17 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.74 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  25.33 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  25.85 
 
 		 164 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  22.73 
 
 		 194 aa  42  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  25.85 
 
 		 164 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  25.85 
 
 		 164 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  25.85 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  26.71 
 
 		 164 aa  42  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  26.32 
 
 		 201 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  26.35 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  26.72 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.48 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  26.72 
 
 		 220 aa  40.8  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>