18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6227 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1604  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6227  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0274044 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6703  hypothetical protein  99.19 
 
 
123 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.640276 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6643  hypothetical protein  84.43 
 
 
123 aa  202  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174293  normal  0.0338703 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5729  hypothetical protein  77.05 
 
 
123 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5974  hypothetical protein  77.05 
 
 
123 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0237314  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5301  hypothetical protein  47.15 
 
 
126 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5385  hypothetical protein  37.4 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1360  hypothetical protein  38.84 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003192  cytochrome P-450:NADPH-P-450 reductase  31.93 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1762  hypothetical protein  34.15 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000014104  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2386  hypothetical protein  38.64 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0528  hypothetical protein  28.81 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1428  hypothetical protein  29.66 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0545971  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2891  hypothetical protein  30.47 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3211  hypothetical protein  31.36 
 
 
127 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.750563  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0198  hypothetical protein  33.03 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0674  hypothetical protein  31.82 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>