18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3399 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4117  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4768  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3399  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5179  hypothetical protein  81.25 
 
 
126 aa  216  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6285  hypothetical protein  70.87 
 
 
125 aa  185  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892062  normal  0.385427 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5689  hypothetical protein  76.38 
 
 
122 aa  174  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118692  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3342  hypothetical protein  80.77 
 
 
128 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0329  putative lipoprotein  52.31 
 
 
155 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738731  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0511  hypothetical protein  52.31 
 
 
155 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2049  hypothetical protein  52.31 
 
 
125 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3043  hypothetical protein  52.31 
 
 
168 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3373  hypothetical protein  52.31 
 
 
165 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0316  putative lipoprotein  51.54 
 
 
155 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2393  hypothetical protein  34.38 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320552  hitchhiker  0.00184098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2209  hypothetical protein  30.53 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116211  normal  0.0459101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0019  hypothetical protein  33.62 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.0246998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0021  hypothetical protein  33.62 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3429  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>