18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5974 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5974  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  247  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0237314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5729  hypothetical protein  95.93 
 
 		 123 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6643  hypothetical protein  75.41 
 
 		 123 aa  190  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174293  normal  0.0338703 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6703  hypothetical protein  77.05 
 
 		 123 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1604  hypothetical protein  77.05 
 
 		 123 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6227  hypothetical protein  77.05 
 
 		 123 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0274044 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5301  hypothetical protein  45 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003192  cytochrome P-450:NADPH-P-450 reductase  31.4 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1360  hypothetical protein  35 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5385  hypothetical protein  33.61 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1762  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000014104  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2386  hypothetical protein  42.61 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0528  hypothetical protein  30.36 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1428  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0545971  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3211  hypothetical protein  30.51 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.750563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2891  hypothetical protein  30.6 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0198  hypothetical protein  33.63 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0674  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>