18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5179 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5179  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  259  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4117  hypothetical protein  81.25 
 
 
128 aa  194  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4768  hypothetical protein  81.25 
 
 
128 aa  194  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3399  hypothetical protein  81.25 
 
 
128 aa  194  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3342  hypothetical protein  91.41 
 
 
128 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6285  hypothetical protein  72.8 
 
 
125 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892062  normal  0.385427 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5689  hypothetical protein  74.34 
 
 
122 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118692  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0329  putative lipoprotein  54.76 
 
 
155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738731  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2049  hypothetical protein  54.76 
 
 
125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0511  hypothetical protein  54.76 
 
 
155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3373  hypothetical protein  54.76 
 
 
165 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3043  hypothetical protein  54.76 
 
 
168 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0316  putative lipoprotein  51.59 
 
 
155 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2393  hypothetical protein  34.92 
 
 
113 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320552  hitchhiker  0.00184098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2209  hypothetical protein  30.95 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116211  normal  0.0459101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0019  hypothetical protein  35.9 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.0246998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0021  hypothetical protein  35.9 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3429  hypothetical protein  31.01 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>