16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4733 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4733  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  263  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.760088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0312  hypothetical protein  72.73 
 
 		 132 aa  204  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1169  hypothetical protein  52.54 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5470  hypothetical protein  42.62 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5025  hypothetical protein  40.16 
 
 		 125 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.665825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4400  hypothetical protein  37.7 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5360  hypothetical protein  36.89 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5312  hypothetical protein  36.07 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.828219  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5221  hypothetical protein  36.07 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6124  hypothetical protein  35.59 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70590  hypothetical protein  34.75 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0161  hypothetical protein  35.65 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.323889  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5561  hypothetical protein  37.7 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2186  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0146743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2149  hypothetical protein  23.85 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1860  hypothetical protein  27.78 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>