28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4405 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4405  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  338  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.105181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4924  hypothetical protein  97.56 
 
 		 164 aa  330  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0696  hypothetical protein  86.59 
 
 		 164 aa  293  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3386  hypothetical protein  86.59 
 
 		 164 aa  290  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680695  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4981  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  86.59 
 
 		 164 aa  290  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5306  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  86.59 
 
 		 164 aa  290  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3639  hypothetical protein  80.49 
 
 		 164 aa  276  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0901  hypothetical protein  49.07 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2604  hypothetical protein  49.07 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2465  hypothetical protein  49.07 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0560  hypothetical protein  47.2 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.343341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3892  hypothetical protein  37.34 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.58 
 
 		 148 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0906319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0829  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0626  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.38 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1119  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.58 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47591 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2550  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.74 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.367677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0250  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.48 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6293  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.99 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0247  hypothetical protein  29.45 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0242  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.87 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4479  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.74 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3868  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.57 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0853747  normal  0.686212 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1866  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.09 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1839  periplasmic protein thiol:disulfide oxidoreductase DsbE  28.77 
 
 		 145 aa  51.2  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2847  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.71 
 
 		 152 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000365676  normal  0.0147483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1534  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.99 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0482501 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.12 
 
 		 143 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.912588  normal  0.440605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>