22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3592 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3592  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  332  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4067  hypothetical protein  98.85 
 
 
174 aa  328  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0208636  normal  0.9668 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1851  hypothetical protein  91.95 
 
 
174 aa  291  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.163042 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4415  hypothetical protein  93.1 
 
 
174 aa  289  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4186  hypothetical protein  92.53 
 
 
174 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.48428  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4180  hypothetical protein  92.53 
 
 
174 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.84562  normal  0.337483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3337  hypothetical protein  92.53 
 
 
174 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3699  hypothetical protein  69.62 
 
 
182 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3376  membrane-bound metal-dependent hydrolase  68.99 
 
 
182 aa  204  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3883  hypothetical protein  65.82 
 
 
185 aa  183  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372764  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4289  membrane-bound metal-dependent hydrolase  67.72 
 
 
171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.208948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0618  hypothetical protein  67.3 
 
 
172 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0268751 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1133  hypothetical protein  72.99 
 
 
172 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0267  hypothetical protein  73.56 
 
 
172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1329  hypothetical protein  73.56 
 
 
172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1826  hypothetical protein  73.56 
 
 
172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437082  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0995  hypothetical protein  73.56 
 
 
172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0588221  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0372  hypothetical protein  73.56 
 
 
172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0329059  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0300  hypothetical protein  73.56 
 
 
172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.861833  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1741  hypothetical protein  72.99 
 
 
172 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631778  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4594  hypothetical protein  63.92 
 
 
174 aa  168  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238145  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4474  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.6 
 
 
153 aa  51.6  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>