17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1925 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1925  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.294161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1852  hypothetical protein  97.83 
 
 
92 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0603448  hitchhiker  0.000139729 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6142  hypothetical protein  91.3 
 
 
92 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1937  hypothetical protein  91.3 
 
 
92 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.222522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1961  hypothetical protein  91.3 
 
 
92 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133312  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5248  hypothetical protein  90.22 
 
 
92 aa  168  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309279  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1334  hypothetical protein  89.13 
 
 
92 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0626491  decreased coverage  0.000050707 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2095  hypothetical protein  59.6 
 
 
97 aa  97.1  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.973371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3327  hypothetical protein  55.24 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000856601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1251  hypothetical protein  55.24 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2506  hypothetical protein  55.24 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1978  hypothetical protein  55.24 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0228206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2350  hypothetical protein  55.24 
 
 
96 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2393  hypothetical protein  54.29 
 
 
96 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2306  hypothetical protein  54.55 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0978479  normal  0.872005 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1004  hypothetical protein  52.43 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794085  normal  0.470694 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1880  hypothetical protein  50.5 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.470646  normal  0.235598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>