17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1715 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1715  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6304  hypothetical protein  94.5 
 
 
218 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1775  hypothetical protein  94.5 
 
 
218 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.379261  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1687  hypothetical protein  97.81 
 
 
183 aa  361  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1800  hypothetical protein  92.9 
 
 
183 aa  346  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.388782 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5074  hypothetical protein  91.8 
 
 
183 aa  343  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515107  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1495  hypothetical protein  89.07 
 
 
183 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2265  hypothetical protein  69.31 
 
 
181 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0096  hypothetical protein  74.84 
 
 
181 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1071  hypothetical protein  74.84 
 
 
181 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2192  hypothetical protein  74.84 
 
 
181 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2155  hypothetical protein  74.84 
 
 
181 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1312  hypothetical protein  74.84 
 
 
181 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1800  hypothetical protein  74.84 
 
 
181 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.375268  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2324  hypothetical protein  48.65 
 
 
185 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0817726  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1862  hypothetical protein  48.65 
 
 
185 aa  184  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259402  normal  0.0803073 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0985  hypothetical protein  51.35 
 
 
186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>