59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1338 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1378  membrane protein  98.51 
 
 		 105 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.792947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1338  membrane protein  100 
 
 		 67 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1457  membrane protein  94.03 
 
 		 105 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446006  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0975  membrane protein  94.03 
 
 		 105 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4602  membrane protein  94.03 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1435  membrane protein  92.54 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1355  hypothetical protein  88.06 
 
 		 106 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.246165 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1574  hypothetical protein  89.55 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2772  hypothetical protein  88.06 
 
 		 106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1792  membrane protein  89.55 
 
 		 105 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0943  hypothetical protein  88.06 
 
 		 106 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1863  hypothetical protein  88.06 
 
 		 106 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0757  hypothetical protein  88.06 
 
 		 106 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1708  membrane protein  88.06 
 
 		 106 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1686  hypothetical protein  88.06 
 
 		 106 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0405  hypothetical protein  88.06 
 
 		 106 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1476  hypothetical protein  88.06 
 
 		 106 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2617  hypothetical protein  88.06 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00580  predicted membrane protein  73.13 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3798  hypothetical protein  62.69 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1560  putative transmembrane protein  70.97 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1251  putative transmembrane protein  67.74 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99205  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1132  hypothetical protein  67.19 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4015  hypothetical protein  65.67 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000344085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1663  putative transmembrane protein  69.35 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3076  hypothetical protein  70.49 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4509  hypothetical protein  64.18 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1402  hypothetical protein  64.18 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.021446  normal  0.593041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1993  putative transmembrane protein  67.74 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.072435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1910  hypothetical protein  60 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1671  membrane protein  60.94 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22630  hypothetical protein  67.27 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000561464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1800  hypothetical protein  56.92 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3594  hypothetical protein  56.92 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.617251  normal  0.663299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1477  membrane protein-like  60 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111378  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1824  membrane protein-like protein  74.47 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0866177  normal  0.631678 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1615  hypothetical protein  55.38 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0271  hypothetical protein  72.55 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00945807  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2828  hypothetical protein  71.15 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2498  hypothetical protein  77.27 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499167  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2721  hypothetical protein  60 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2654  hypothetical protein  71.15 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3293  hypothetical protein  67.39 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000025592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1127  hypothetical protein  64.71 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.958574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2916  hypothetical protein  73.81 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.234722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0835  hypothetical protein  60.78 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310585  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1468  hypothetical protein  71.43 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.722008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1432  hypothetical protein  71.43 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1438  hypothetical protein  72.5 
 
 		 101 aa  67  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1256  hypothetical protein  55.93 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.341048  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2647  hypothetical protein  52.46 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4965  membrane protein  67.5 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0713877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2895  hypothetical protein  58.49 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.111325  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5233  hypothetical protein  53.12 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2375  hypothetical protein  51.72 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276306  normal  0.0198627 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0172  hypothetical protein  40.3 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0998  hypothetical protein  43.08 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.173799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1220  hypothetical protein  43.55 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3518  hypothetical protein  44.93 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>