61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0550 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  99.45 
 
 		 183 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  91.28 
 
 		 183 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  91.41 
 
 		 177 aa  308  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  90.24 
 
 		 176 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  90.24 
 
 		 176 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  90.24 
 
 		 176 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  74.56 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  74.56 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  74.56 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  74.56 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  74.56 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  74.56 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  67.61 
 
 		 183 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  76.43 
 
 		 176 aa  235  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  73.91 
 
 		 176 aa  233  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3379  rare lipoprotein B  59.88 
 
 		 183 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0577  rare lipoprotein B  60.87 
 
 		 169 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  45.21 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  40.37 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2743  putative lipoprotein B precursor transmembrane  43.66 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2572  Rare lipoprotein B  40.85 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.613264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2982  Rare lipoprotein B  40.85 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  40.56 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  32.47 
 
 		 172 aa  88.2  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  36.25 
 
 		 179 aa  87.8  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  37.86 
 
 		 163 aa  85.5  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  37.5 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  35.76 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0759  rare lipoprotein B  33.11 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4604  rare lipoprotein B  33.33 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  33.11 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0423  Rare lipoprotein B  35.62 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3265  Rare lipoprotein B  32.89 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3916  rare lipoprotein B  32.89 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0217  putative lipoprotein B precursor  36.42 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4547  rare lipoprotein B  35.4 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0255  rare lipoprotein B precursor  29.88 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0233  rare lipoprotein B precursor  27.67 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  32.56 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  27.39 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1072  rare lipoprotein B  31.25 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  29.53 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0480  rare lipoprotein B  29.5 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0401  rare lipoprotein B-like protein  32.28 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  31.4 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01875  lipoprotein  32.14 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  28.83 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  25 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  27.61 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  28.65 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  29.61 
 
 		 203 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2144  rare lipoprotein B  27.91 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  26.22 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  23.46 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  29.53 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  29.76 
 
 		 202 aa  44.3  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  26.97 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  29.76 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1507  rare lipoprotein B precursor  25.89 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0236353  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0672  hypothetical protein  25.15 
 
 		 206 aa  40.8  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00531564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>