22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4067 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4067  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  331  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0208636  normal  0.9668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3592  hypothetical protein  98.85 
 
 		 174 aa  328  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1851  hypothetical protein  91.95 
 
 		 174 aa  291  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.163042 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4415  hypothetical protein  91.95 
 
 		 174 aa  286  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4186  hypothetical protein  93.68 
 
 		 174 aa  276  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.48428  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4180  hypothetical protein  93.68 
 
 		 174 aa  276  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.84562  normal  0.337483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3337  hypothetical protein  93.68 
 
 		 174 aa  276  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3699  hypothetical protein  68.99 
 
 		 182 aa  204  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3376  membrane-bound metal-dependent hydrolase  68.35 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4289  membrane-bound metal-dependent hydrolase  67.72 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.208948 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3883  hypothetical protein  64.56 
 
 		 185 aa  180  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1133  hypothetical protein  74.14 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0618  hypothetical protein  67.3 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0268751 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0267  hypothetical protein  74.71 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1329  hypothetical protein  74.71 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1826  hypothetical protein  74.71 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437082  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0995  hypothetical protein  74.71 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0588221  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0372  hypothetical protein  74.71 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0329059  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0300  hypothetical protein  74.71 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.861833  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1741  hypothetical protein  74.14 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631778  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4594  hypothetical protein  63.29 
 
 		 174 aa  167  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238145  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4474  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.6 
 
 		 153 aa  50.8  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>